若干混乱してきましたので再確認させていただきます。
事業、家庭混用のカード2枚ありますので、カード明細入力・負債科目でAカード、Bカードを作成しました。カードによる仕入れ商品は新規入力で負債科目＝AまたはBカード、科目＝仕入れ先名を作成し入力する。また、カードによる経費商品については新規入力で負債科目＝AまたはBカード、科目＝支払先名を作成し入力する。カード利用明細に事業用分をマークして事業用分だけの入力でよいでしょうか。この後仕入れ商品を買掛金に、経費商品を該当の経費科目へ振り替える作業は必要ないのでしょうか。よろしくお願いします。

> カード利用明細に事業用分をマークして事業用分だけの入力でよいでしょうか。

マークというのが[*]のことでしたら、これは領収書とカード利用明細のチェック済みという意味ですので、事業用かどうかは関係ありません。
事業用は、帳簿＝「青色申告」とします。
カードが事業専用ではないということなので、事業用のみの入力で決算書は作成できます。
この場合、カードの入力科目は「事業主借（貸）」に集計します。

> この後仕入れ商品を買掛金に、経費商品を該当の経費科目へ振り替える作業は必要ないのでしょうか。

カードで仕入をする場合は、現金同様と考えて買掛管理の必要はないのではないかと思うのですが、専門家ではありませんので確信はありません。どうなのでしょうか？
どうしても決算書で買掛金に計上する場合は、決算時に仕入先別の買掛残高を計算して振り替えることになるかと思います。

経費科目については、[2662]の通りです。