お世話になっております。一度アンインストールを行なうため、
（１）コントロールパネルの「アプリケーションの追加と削除」を開く
（２）[Microsoft Office Access 2003 Runtime]を選択し「削除」をクリックする。
をやってみたのですが、エラー1316　ファイルC:\〜.msi から読み込めません。と表示されて止まってしまいます。何とか削除する方法はないでしょうか？　お手数ですがアドバイスをお願いします。

インストールを実行した時のフォルダは、そのままの状態で残っていますでしょうか。
インストールを実行すると、実行した「SETUP.EXE」と同じフォルダに[Files]というフォルダが作成され、その中に[ACCESSRT.msi][IJssel会計.msi]が保存されます。
アンインストール時にはこれらのファイルが必要となります。

ご返信ありがとうございます。
それらのフォルダは見つかりませんでした。
新しくインストールしようとしたのですが、できませんでした。
何か方法は無いでしょうか？

インストールされたのはいつ頃でしょうか？
インストールからあまり時間がたっていないのであれば、実際にはフォルダが残っているかもしれません。
かなり時間が経過して、故意にフォルダを削除されたりしたことにより、インストール時の情報が残っていないとなると、当方でお答えできる範囲を超えています。

このようなケースについて下記のページがよくまとめられています。
http://pctrouble.lessismore.cc/running/cannot_uninstall.html

このページの下の方に「アンインストールできない場合の対処法 − その［２］」という項目があります。
参考になりますでしょうか。

> インストールを実行すると、実行した「SETUP.EXE」と同じフォルダに[Files]というフォルダが作成され、その中に[ACCESSRT.msi][IJssel会計.msi]が保存されます。

これらのファイルは、インストール実行時ではなく、ダウンロードされた圧縮ファイルを解凍すると作成されます。
インストールを実行したフォルダのパスがわかれば、同じ場所で解凍することによりインストール時の情報が復元され、アンインストールできるかもしれませんが、確証はありません。