お世話になります。
申し訳ございませんが、確認をお願いできますか？

車を購入しました。100％事業用です。
支払いは事業用として使用している口座からの振り込みです。

(1)購入時に
　「預金通帳を入力する」
　　　↓
　資産科目：普通預金
　日付：購入日
　科目：Ａ車（資産科目として作成）→『車両運搬具』に集計

(2)「伝票入力サブメニュー」
　　　　↓
　　「支出元帳」
　　　　↓
　　支出科目：減価償却費
　　日付：2012年12月31日
　　科目：Ａ車
　　支出金額：本年分の必要経費算入額

以上のような入力で大丈夫でしょうか？
よろしくお願いいたします。

> 以上のような入力で大丈夫でしょうか？

大丈夫だと思います。
貸借対照表の「車輌運搬具」に、車の購入費から減価償却費分を引いた金額が、損益計算書の「減価償却費」に減価償却費分が計上されていることを確認して下さい。

> 貸借対照表の「車輌運搬具」に、車の購入費から減価償却費分を引いた金額が、損益計算書の「減価償却費」に減価償却費分が計上されていることを確認して下さい。

確認しましたところ
貸借対照表の「車輌運搬具」には、『車の購入費-減価償却費分』が、
損益計算書の「減価償却費」には、『減価償却費分』が
計上されていました。